Banyak senyawa dimurnikan dengan kristalisasi dari larutan berair. Kristal tidak termasuk banyak kontaminan, namun, air dapat masuk ke dalam kisi kristal tanpa terikat secara kimiawi dengan kation senyawa. Menerapkan panas dapat mengusir air ini, tetapi prosesnya biasanya merusak struktur kristal. Ini bagus, jika tujuannya adalah untuk mendapatkan senyawa murni. Mungkin tidak diinginkan ketika menumbuhkan kristal untuk kristalografi atau tujuan lain.
Terkadang kedua bentuk itu digabungkan. Misalnya, [Cu (H2HAI)4]BEGITU4· H2O dapat digunakan untuk menggambarkan air kristalisasi tembaga (II) sulfat.
Air adalah molekul kecil polar yang mudah dimasukkan ke dalam kisi kristal, tetapi itu bukan satu-satunya pelarut yang ditemukan dalam kristal. Faktanya, sebagian besar pelarut tetap, pada tingkat yang lebih besar atau lebih kecil, dalam kristal. Contoh umum adalah benzena. Untuk meminimalkan efek pelarut, ahli kimia biasanya mencoba untuk menghapus sebanyak mungkin menggunakan ekstraksi vakum dan dapat memanaskan sampel untuk mengusir sisa pelarut. Kristalografi sinar-X sering dapat mendeteksi pelarut dalam kristal.