Evolusi adalah perubahan spesies dari waktu ke waktu. Namun dengan caranya ekosistem bekerja di Bumi, banyak spesies memiliki hubungan dekat dan penting satu sama lain untuk memastikan kelangsungan hidup mereka. Hubungan simbiotik ini, seperti hubungan predator-mangsa, menjaga biosfer berjalan dengan benar dan menjaga agar spesies tidak punah. Ini berarti ketika satu spesies berevolusi, itu akan mempengaruhi spesies lain dalam beberapa cara. Koevolusi spesies ini seperti perlombaan senjata evolusioner yang menegaskan bahwa spesies lain dalam hubungan itu juga harus berevolusi untuk bertahan hidup.
Hipotesis “Ratu Merah” dalam evolusi terkait dengan evolusi bersama spesies. Ini menyatakan bahwa spesies harus terus beradaptasi dan berevolusi untuk mewariskan gen ke generasi berikutnya dan juga agar tidak punah ketika spesies lain dalam hubungan simbiotik berkembang. Pertama kali diusulkan pada tahun 1973 oleh Leigh Van Valen, bagian dari hipotesis ini sangat penting dalam hubungan predator-mangsa atau hubungan parasit.
Sumber makanan bisa dibilang salah satu jenis hubungan terpenting dalam hal kelangsungan hidup suatu spesies. Misalnya, jika spesies mangsa berkembang menjadi lebih cepat selama periode waktu tertentu, pemangsa perlu beradaptasi dan berevolusi untuk tetap menggunakan mangsa sebagai sumber makanan yang dapat diandalkan. Jika tidak, mangsa yang sekarang lebih cepat akan melarikan diri, dan pemangsa akan kehilangan sumber makanan dan berpotensi punah. Namun, jika predator menjadi lebih cepat dengan sendirinya, atau berevolusi dengan cara lain seperti menjadi lebih tersembunyi atau menjadi pemburu yang lebih baik, maka hubungan dapat berlanjut, dan predator akan bertahan. Menurut hipotesis Ratu Merah, koevolusi bolak-balik spesies ini adalah perubahan konstan dengan adaptasi yang lebih kecil terakumulasi dalam periode waktu yang lama.
Bagian lain dari hipotesis Ratu Merah berkaitan dengan seleksi seksual. Ini berkaitan dengan bagian pertama dari hipotesis sebagai mekanisme untuk mempercepat evolusi dengan sifat-sifat yang diinginkan. Spesies yang mampu memilih pasangan daripada menjalani reproduksi aseksual atau tidak memiliki kemampuan untuk memilih pasangan dapat mengidentifikasi karakteristik pasangan yang diinginkan dan akan menghasilkan keturunan yang lebih cocok untuk lingkungan. Mudah-mudahan, pencampuran sifat yang diinginkan ini akan mengarah pada keturunan yang dipilih seleksi alam dan spesies akan terus berlanjut. Ini adalah mekanisme yang sangat membantu untuk satu spesies dalam hubungan simbiosis jika spesies lain tidak dapat menjalani seleksi seksual.
Contoh dari jenis interaksi ini adalah hubungan inang dan parasit. Individu yang ingin kawin di suatu daerah dengan banyak hubungan parasit mungkin mencari pasangan yang tampaknya kebal terhadap parasit. Karena sebagian besar parasit aseksual atau tidak dapat menjalani seleksi seksual, maka spesies yang dapat memilih pasangan imun memiliki keunggulan evolusi. Tujuannya adalah untuk menghasilkan keturunan yang memiliki sifat yang membuat mereka kebal terhadap parasit. Ini akan membuat keturunan lebih cocok untuk lingkungan dan lebih cenderung hidup cukup lama untuk mereproduksi diri sendiri dan mewariskan gen.
Hipotesis ini tidak berarti bahwa parasit dalam contoh ini tidak akan dapat hidup berdampingan. Ada lebih banyak cara untuk mengakumulasikan adaptasi dari sekadar seleksi pasangan seksual. Mutasi DNA juga dapat menghasilkan perubahan dalam kumpulan gen hanya karena kebetulan. Semua organisme terlepas dari gaya reproduksinya dapat mengalami mutasi kapan saja. Ini memungkinkan semua spesies, bahkan parasit, untuk hidup bersama ketika spesies lain dalam hubungan simbiosis mereka juga berevolusi.