Sejumlah struktur terletak di mesencephalon termasuk tectum, tegmentum, tangkai serebral, substantia nigra, crus cerebri, dan saraf kranial (oculomotor dan trochlear). Itu tektum terdiri dari tonjolan bulat yang disebut colliculi yang terlibat dalam proses penglihatan dan pendengaran. Itu tangkai serebral adalah bundel serabut saraf yang menghubungkan otak depan dan otak belakang. Batang serebral termasuk tegementum (bentuk dasar otak tengah) dan crus cerebri (saluran saraf yang menghubungkan otak besar dengan otak kecil). Itu substantia nigra memiliki koneksi saraf dengan lobus frontal dan area lain dari otak yang terlibat dalam fungsi motorik. Sel-sel dalam substantia nigra juga menghasilkan dopamin, pembawa pesan kimia yang membantu mengoordinasikan otot gerakan.
Regenerasi saraf pada sel-sel saraf dalam substantia nigra menghasilkan penurunan produksi dopamin. Kehilangan kadar dopamin yang signifikan (60-80%) dapat menyebabkan perkembangan penyakit Parkinson. Penyakit Parkinson adalah a
sistem saraf gangguan yang mengakibatkan hilangnya kontrol dan koordinasi motorik. Gejala-gejalanya termasuk tremor, lambatnya gerakan, kekakuan otot, dan masalah keseimbangan.