Silia dan flagela memiliki inti yang tersusun atas mikrotubulus yang terhubung ke membran plasma dan diatur dalam apa yang dikenal sebagai a Pola 9 + 2. Pola ini dinamakan demikian karena terdiri dari cincin set pasangan mikrotubulus sembilan (doublets) yang mengelilingi dua tunggal mikrotubulus. Bundel mikrotubulus ini dalam susunan 9 + 2 disebut a aksonem. Basis silia dan flagella terhubung ke sel dengan dimodifikasi centriole struktur yang disebut badan basal. Gerakan dihasilkan ketika sembilan pasang mikrotubulus dari geser aksonem terhadap satu sama lain menyebabkan silia dan flagela menekuk. Motor protein dynein bertanggung jawab untuk menghasilkan gaya yang diperlukan untuk pergerakan. Jenis organisasi ini ditemukan di sebagian besar silia eukariotik dan flagela.
Fungsi utama dari silia dan flagela adalah gerakan. Mereka adalah sarana dimana banyak organisme mikroskopis uniseluler dan multiseluler berpindah dari satu tempat ke tempat lain. Banyak dari organisme ini ditemukan di lingkungan berair, di mana mereka didorong oleh pemukulan silia atau aksi flagella seperti cambuk.
Protista dan bakteri, misalnya, gunakan struktur ini untuk bergerak ke arah rangsangan (makanan, cahaya), jauh dari rangsangan (toksin), atau untuk mempertahankan posisi mereka di lokasi umum. Pada organisme tingkat tinggi, silia sering digunakan untuk mendorong zat ke arah yang diinginkan. Namun, beberapa silia tidak berfungsi dalam gerakan tetapi dalam penginderaan. Silia primer, ditemukan di beberapa organ dan kapal, dapat merasakan perubahan kondisi lingkungan. Sel-sel yang melapisi dinding pembuluh darah mencontohkan fungsi ini. Silia primer dalam sel endotel pembuluh darah memantau kekuatan darah mengalir melalui kapal.Baik silia dan flagela banyak ditemukan jenis sel. Misalnya, sperma dari banyak binatang, ganggang, dan bahkan pakis memiliki flagela. Organisme prokariotik juga dapat memiliki flagel tunggal atau lebih. Bakteri, misalnya, mungkin memiliki: satu flagel yang terletak di salah satu ujung sel (montrichous), satu atau lebih flagela yang terletak di kedua ujung sel (amphitrichous), beberapa flagela di salah satu ujung sel (lophotrichous), atau flagela didistribusikan di sekitar sel (peritrichous). Silia dapat ditemukan di berbagai bidang seperti saluran pernafasan dan saluran reproduksi wanita. Di saluran pernapasan, silia membantu menyapu lendir yang mengandung debu, kuman, serbuk sari, dan puing - puing lain dari paru-paru. Pada saluran reproduksi wanita, silia membantu menyapu sperma ke arah rahim.