Ini paling sering terjadi karena isolasi geografis atau isolasi reproduktif individu dalam populasi. Ketika spesies berevolusi dan bercabang, mereka tidak bisa lagi kawin dengan anggota spesies asli.
Empat jenis spesiasi alami dapat terjadi berdasarkan isolasi reproduktif atau geografis, antara lain alasan dan faktor lingkungan.
Awalan allo- berarti "lainnya." Akhiran -patric, berarti "tempat." Jadi allopatric adalah jenis spesiasi yang disebabkan oleh isolasi geografis. Individu yang terisolasi secara harfiah di "tempat lain."
Mekanisme paling umum untuk isolasi geografis adalah penghalang fisik aktual yang terjadi di antara anggota populasi. Ini bisa berupa sesuatu yang sekecil pohon tumbang untuk organisme kecil atau sebesar terbelah oleh lautan.
Spesiasi allopatric tidak berarti dua populasi yang berbeda tidak dapat berinteraksi atau bahkan berkembang biak pada awalnya. Jika penghalang yang menyebabkan isolasi geografis dapat diatasi, beberapa anggota dari populasi yang berbeda dapat melakukan perjalanan bolak-balik. Tetapi mayoritas populasi akan tetap terisolasi satu sama lain dan, sebagai akibatnya, mereka akan menyimpang menjadi spesies yang berbeda.
Awalan peri- berarti "dekat." Saat ditambahkan ke akhiran -patric, artinya "dekat tempat." Spesiasi yang bergerak sebenarnya adalah tipe khusus dari spesiasi allopatrik. Masih ada semacam isolasi geografis, tetapi ada juga semacam contoh yang menyebabkan sangat sedikit individu untuk bertahan hidup di populasi yang terisolasi dibandingkan dengan spesiasi allopatric.
Dalam spesiasi bergerak, ini mungkin merupakan kasus ekstrim isolasi geografis di mana hanya beberapa individu yang terisolasi, atau dapat mengikuti tidak hanya isolasi geografis tetapi juga semacam bencana yang membunuh semua tetapi beberapa yang terisolasi populasi. Dengan kumpulan gen sekecil itu, gen langka diturunkan lebih sering, yang menyebabkannya pergeseran genetik. Individu yang terisolasi dengan cepat menjadi tidak kompatibel dengan spesies sebelumnya dan menjadi spesies baru.
Akhiran -patric masih berarti "tempat" dan saat awalan para-, atau "di samping", terlampir, ini menyiratkan bahwa kali ini populasi tidak diisolasi oleh penghalang fisik dan sebaliknya "di samping" satu sama lain.
Meskipun tidak ada yang menghentikan individu dalam seluruh populasi dari percampuran dan perkawinan, itu masih tidak terjadi dalam spesiasi parapatric. Untuk beberapa alasan, individu dalam populasi hanya kawin dengan individu di wilayah terdekat mereka.
Beberapa faktor yang dapat mempengaruhi spesiasi parapatric termasuk polusi atau ketidakmampuan untuk menyebarkan benih untuk tanaman. Namun, agar dapat diklasifikasikan sebagai spesiasi parapatric, populasi harus kontinu tanpa hambatan fisik. Jika ada hambatan fisik, itu perlu diklasifikasikan sebagai isolasi bergerak atau allopatric.
Jenis terakhir disebut spesiasi sympatric. Awalan sym-, yang berarti "sama" dengan akhiran -patric, yang berarti "tempat" memberikan petunjuk tentang arti jenis spesiasi ini: Individu dalam populasi adalah tidak terpisah sama sekali dan semua hidup di "tempat yang sama." Jadi bagaimana populasi berbeda jika mereka hidup dalam lingkungan yang sama ruang?
Penyebab paling umum dari spesiasi simpatrik adalah isolasi reproduksi. Isolasi reproduksi mungkin disebabkan oleh individu yang memasuki musim kawin mereka pada waktu yang berbeda atau preferensi di mana menemukan pasangannya. Pada banyak spesies, pilihan pasangan mungkin didasarkan pada pengasuhan mereka. Banyak spesies kembali ke tempat mereka dilahirkan untuk kawin. Oleh karena itu, mereka hanya akan dapat kawin dengan orang lain yang dilahirkan di tempat yang sama, tidak peduli ke mana mereka pindah dan hidup sebagai orang dewasa.
Alasan lain bisa jadi bahwa populasi yang berbeda menjadi tergantung pada kebutuhan yang berbeda di lingkungan, seperti sumber makanan atau tempat tinggal.